เพื่อให้การสงเคราะห์ทหารผ่านศึก ครอบครัวทหารผ่านศึก ทหารนอกประจำการ และผู้ที่กำลังปฏิบัติหน้าที่ในการ ป้องกันประเทศ ซึ่งในปัจจุบันมีจำนวนกว่าห้าแสนเก้าหมื่นคน การบริหารสภาทหารผ่านศึก มีอำนาจหน้าที่ในการวาง นโยบาย และควบคุมกิจการทั่วไปขององค์การสงเคราะห์ทหารผ่านศึก สภาทหารผ่านศึก ประกอบด้วย รัฐมนตรี ว่าการกระทรวงกลาโหม เป็นนายกสภาทหารผ่านศึก ผู้อำนวยการ
องค์การสงเคราะห์ทหารผ่านศึก เป็นอุปนายก รองผู้อำนวยการองค์การสงเคราะห์ทหารผ่านศึก เป็นกรรมการโดยตำแหน่ง และยังมีกรรมการซึ่งรัฐมนตรี ว่าการกระทรวงกลาโหมแต่งตั้ง ด้วยความเห็นชอบของสภากลาโหม ประกอบด้วยทหารผ่านศึกประจำการ ๗ คน ทหารผ่านศึกนอกประจำการ ๙ คน และเลขานุการองค์การสงเคราะห์ทหารผ่านศึก เป็นเลขาธิการของสภาทหาร ผ่านศึกโดยตำแหน่ง
ผู้อำนวยการฯ เป็นผู้บริหารกิจการขององค์การสงเคราะห์ทหารผ่านศึกให้เป็นไปตามกฎหมายข้อบังคับ และนโยบาย ที่สภาทหารผ่านศึกกำหนด และมีอำนาจบังคับบัญชาพนักงาน ตลอดจน ลูกจ้างทุกตำแหน่ง รวมทั้งรับผิดชอบใน การจัดการและการดำเนินงานขององค์การฯ ซึ่งมีทั้งในส่วนกลางและ ส่วนภูมิภาค โดยในส่วนกลางนั้นมีสำนัก งานใหญ่ตั้งอยู่ในกรุงเทพมหานคร ส่วนภูมิภาคมีสำนักงานสาขา ๒๕ แห่ง อีกทั้งยังมีหน่วยงานกิจการพิเศษที่อยู่ ในความดูแลอีก ๖ หน่วย คือ สำนักงานกิจการศาลหลักเมือง สำนักงานกิจการการเกษตรการอุตสาหกรรมและ การบริการ สำนักงานกิจการโรงพิมพ์ สำนักงานรักษาความปลอดภัย สำนักงานจัดจำหน่ายสลากกินแบ่งและบุหรี่ และสำนักงานกิจการโรงงานในอารักษ์